Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4G9

Rmi1, RecQ-mediated genome instability protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi1Q9D4G9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmi1Q9D4G9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmi1Q9D4G9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rmi1Q9D4G9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rmi1Q9D4G9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmi1Q9D4G9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmi1Q9D4G9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmi1Q9D4G9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmi1Q9D4G9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms