Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed11Q9D2R4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed11Q9D2R4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed11Q9D2R4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed11Q9D2R4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed11Q9D2R4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed11Q9D2R4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed11Q9D2R4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed11Q9D2R4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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