Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Snapc3Q9D2C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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Snapc3Q9D2C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snapc3Q9D2C9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Snapc3Q9D2C9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Snapc3Q9D2C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Snapc3Q9D2C9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Snapc3Q9D2C9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snapc3Q9D2C9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Snapc3Q9D2C9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Snapc3Q9D2C9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Snapc3Q9D2C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Snapc3Q9D2C9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snapc3Q9D2C9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snapc3Q9D2C9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snapc3Q9D2C9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snapc3Q9D2C9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snapc3Q9D2C9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snapc3Q9D2C9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms