Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf9Q9D0B0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srsf9Q9D0B0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms