Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Acer3Q9D099 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Acer3Q9D099 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Acer3Q9D099 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acer3Q9D099 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Acer3Q9D099 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acer3Q9D099 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acer3Q9D099 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms