Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shmt2Q9CZN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shmt2Q9CZN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shmt2Q9CZN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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