Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdhd3Q9CYW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdhd3Q9CYW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms