Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr1Q9CY50 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssr1Q9CY50 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssr1Q9CY50 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssr1Q9CY50 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.8 ms