Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl11Q9CXW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl11Q9CXW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms