Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nip7Q9CXK8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nip7Q9CXK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nip7Q9CXK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nip7Q9CXK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nip7Q9CXK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nip7Q9CXK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nip7Q9CXK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms