Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm5Q9CXE0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm5Q9CXE0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm5Q9CXE0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm5Q9CXE0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms