Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd8Q9CX56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd8Q9CX56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd8Q9CX56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd8Q9CX56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms