Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sppl3Q9CUS9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sppl3Q9CUS9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sppl3Q9CUS9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sppl3Q9CUS9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sppl3Q9CUS9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms