Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhfpl3Q9CTN8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms