Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhobtb3Q9CTN4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhobtb3Q9CTN4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms