Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dis3Q9CSH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Dis3Q9CSH3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dis3Q9CSH3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dis3Q9CSH3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dis3Q9CSH3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dis3Q9CSH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms