Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspo2Q9CRZ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspo2Q9CRZ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspo2Q9CRZ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms