Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc96Q9CR92 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc96Q9CR92 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc96Q9CR92 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc96Q9CR92 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms