Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR84

Atp5g1, ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g1Q9CR84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5g1Q9CR84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g1Q9CR84 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5g1Q9CR84 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5g1Q9CR84 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms