Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl35Q9CQL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Mrpl35Q9CQL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mrpl35Q9CQL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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