Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms