Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZCCHC2Q9C0B9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC2Q9C0B9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC2Q9C0B9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC2Q9C0B9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms