Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM5Q9C035 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM5Q9C035 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM5Q9C035 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM5Q9C035 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms