Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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