Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF1Q9BYJ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms