Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PCGF6Q9BYE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PCGF6Q9BYE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PCGF6Q9BYE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PCGF6Q9BYE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCGF6Q9BYE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms