Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL1Q9BYD6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL1Q9BYD6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms