Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL13Q9BYD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL13Q9BYD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL13Q9BYD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms