Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
SCAPERQ9BY12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SCAPERQ9BY12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SCAPERQ9BY12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SCAPERQ9BY12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms