Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD1Q9BXT4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD1Q9BXT4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD1Q9BXT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD1Q9BXT4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1232.2 ms