Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYCP2Q9BX26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYCP2Q9BX26 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYCP2Q9BX26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYCP2Q9BX26 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms