Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDA1Q9BW61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
DDA1Q9BW61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDA1Q9BW61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms