Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KATNB1Q9BVA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KATNB1Q9BVA0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
KATNB1Q9BVA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms