Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM208Q9BTX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM208Q9BTX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM208Q9BTX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms