Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC1Q9BTX1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC1Q9BTX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC1Q9BTX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC1Q9BTX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms