Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG101Q9BSB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG101Q9BSB4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG101Q9BSB4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms