Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TXNDC17Q9BRA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TXNDC17Q9BRA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TXNDC17Q9BRA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TXNDC17Q9BRA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TXNDC17Q9BRA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TXNDC17Q9BRA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TXNDC17Q9BRA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms