Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf43Q9BQ61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf43Q9BQ61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms