Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2a1Q99PM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2a1Q99PM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2a1Q99PM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2a1Q99PM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms