Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim3Q99PE5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim3Q99PE5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim3Q99PE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms