Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rtn4Q99P72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtn4Q99P72 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtn4Q99P72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rtn4Q99P72 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms