Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trem2Q99NH8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trem2Q99NH8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trem2Q99NH8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trem2Q99NH8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 302.6 ms