Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NsmfQ99NF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NsmfQ99NF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NsmfQ99NF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NsmfQ99NF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NsmfQ99NF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NsmfQ99NF2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms