Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rims1Q99NE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rims1Q99NE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rims1Q99NE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rims1Q99NE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rims1Q99NE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rims1Q99NE5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rims1Q99NE5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rims1Q99NE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms