Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl43Q99N89 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl43Q99N89 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl43Q99N89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl43Q99N89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms