Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel1Q99MW3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel1Q99MW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel1Q99MW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramel1Q99MW3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms