Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mccc1Q99MR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mccc1Q99MR8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mccc1Q99MR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mccc1Q99MR8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mccc1Q99MR8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms