Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp4Q99ME9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp4Q99ME9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp4Q99ME9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtpbp4Q99ME9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp4Q99ME9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms