Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tm2d1Q99MB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tm2d1Q99MB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tm2d1Q99MB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms