Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprtQ99M80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PtprtQ99M80 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PtprtQ99M80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PtprtQ99M80 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprtQ99M80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprtQ99M80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprtQ99M80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprtQ99M80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprtQ99M80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PtprtQ99M80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtprtQ99M80 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtprtQ99M80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtprtQ99M80 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PtprtQ99M80 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprtQ99M80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprtQ99M80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PtprtQ99M80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms